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2014年學校官網(wǎng)顯示，學校建有南通地區(qū)唯一的國家級化工行業(yè)特有工種技能鑒定站——江蘇省農(nóng)藥廢水處理與資源化技術研發(fā)中心，建筑節(jié)能及保溫技術、數(shù)控機床加工精度2個市級重點實驗室，數(shù)控技術、建筑工程、精細化工、樓宇弱電系統(tǒng)科技服務4個市級公共服務平臺，電子信息、項目管理、應用化工、環(huán)境工程、民營企業(yè)5個校級研究所。
2009年，學校獲得年度市社科基金項目一般課題2項; 2010年，南通職大共計獲得各類科技項目7項，資助經(jīng)費57萬元。
2013年，學校陳蔓生、吳明圣合著論文《基于南通沿海開發(fā)中的產(chǎn)業(yè)結構優(yōu)化研究——利用麥肯錫矩陣對南通沿海開發(fā)中海洋主導產(chǎn)業(yè)選擇分析》榮獲江蘇省哲學社會科學一等獎，朱天高、劉天鵬等論文分獲二、三等獎。
